近年来，榆林市依托丰富的矿产资源和我国能源化工基地的建设，形成了以煤炭、石油、天然气、岩盐采掘为基础，能源、化工为支柱的产业体系，成为国家“西煤东运”、“西气东输”的重要基地和国家重要的产能大市，社会经济呈快速发展态势。然而，经济发展为生态环境保护和建设奠定了良好基础的同时，也给生态脆弱区的生态环境带来了巨大的压力。
煤炭开采引发的地质环境问题严重
榆林市现有煤炭企业266家，年煤炭开采量达3.6亿多吨，但煤炭开发中极易引发地面塌陷、地下水含水层破坏、地表水渗漏等一系列的生态环境问题。如榆林市因煤矿地下开采形成的采空区面积为400多平方公里，现在仍在以每年30平方公里的速度在增加，已造成塌陷面积90多平方公里，矿区直接占用和破坏林地面积达130平方公里。
由于榆林大部分的煤炭资源分布在风沙草滩区，这个区域也是榆林市地下水资源的富集区，区域地势平坦，水源丰富，宜林宜牧，是陕北的生态屏障。而含煤层主要分布在地下含水层之下，煤炭开采过程势必造成地下含水层的破坏，区域性地表水渗漏，地下水位下降。如府谷、神木、榆阳等县区的煤炭开采区地下水位均已明显下降，数十处井泉下漏，淤坝干涸，导致人畜饮水困难。目前，神木县已有数十条河流地表径流断流，20多个泉眼干枯，窟野河两岸大小煤矿连片开发，造成全年三分之二时间断流变成季节河。
交通建设割裂了生物通道
榆林交通体系发展迅速，已先后建成神延铁路、包神铁路、神朔复线铁路，太中银铁路，形成“两横一纵”的铁路格局。建成青银高速、包茂高速榆林段、榆神高速，201国道、307国道穿境而过。但交通体系的大规模建设会增加生态景观系统的破碎程度，阻隔了动物的通行通道。如榆神高速公路穿越神木臭柏自然保护区，将保护区分割成几块，使保护区破碎化程度增加。
水库建设引起自然连通性降低
榆林市在上世纪六七十年代开始建设了大量水利工程，至90年代有多达287座水库。虽然由于泥沙淤积和年久失修，许多水库已报废，但到目前剩余水库仍有100余座，其中大中型水库主要分布在芦河、无定河、榆溪河、秃尾河上，已形成红柳河、芦河、榆溪河三个库坝群。小型水库遍布于黄土丘陵沟壑区。水库的大规模修建造成河流径流量的锐减，对河流自然生态系统产生严重影响。如秃尾河在2003年和2008年分别修建了两座中型水库——瑶镇水库、采兔沟水库。两座水库建成以后，虽拦截了设计流域的洪水和泥沙，但河道径流量明显减低，由建坝前的约6.5亿立方米，减少到约4.5亿立方米。同时下垫面条件发生了显著变化，由此可见水库的修建对河流径流量产生了严重影响。